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博濟(jì)醫(yī)藥科技股份有限公司
股票代碼為(300404)創(chuàng)建于2002年,2015年在深圳創(chuàng)業(yè)板上市,是一家為國(guó)內(nèi)外醫(yī)藥企業(yè)提供藥品、保健品、醫(yī)療器械研發(fā)與生產(chǎn)全流程“一站式”外包服務(wù)(CRO)的型高新技術(shù)企業(yè),同也提供藥品上市許可持有人(MAH)服務(wù)。
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藥品研發(fā)“一站式”服務(wù)包括:新藥立項(xiàng)研究和活性篩選、藥學(xué)研究(含中試生產(chǎn))、藥理毒理研究、臨床用藥與模擬劑的生產(chǎn)、臨床試驗(yàn)、臨床數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析、上市后再評(píng)價(jià)、技
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公司新聞
袁來如此|大分子生物分析概論(五):LBA方法的平行性評(píng)估,基質(zhì)效應(yīng),靈敏度和選擇性
作者:廣州博濟(jì)醫(yī)藥 時(shí)間:2021-03-31 來源:廣州博濟(jì)醫(yī)藥

本文為大分子生物分析概論系列文章的第五篇,主要介紹LBA方法的平行性(parallelism)實(shí)驗(yàn)或研究,這是大分子藥物分析方法所特有的一項(xiàng)研究。平行性是評(píng)估配體結(jié)合式測(cè)試方法(ligand-binding assay,LBA)相對(duì)準(zhǔn)確性的關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)。


在這個(gè)實(shí)驗(yàn)中,將采用平行性研究,即通過評(píng)估稀釋對(duì)生物基質(zhì)中內(nèi)源性待測(cè)物定量的影響,來表述一個(gè)分析方法的相對(duì)準(zhǔn)確性,可以評(píng)估的基本特征包括選擇性、基質(zhì)效應(yīng)、所需的最小稀釋倍數(shù)、健康和患病人群的內(nèi)源性待測(cè)物的水平以及LLOQ。本文將比較并討論評(píng)估支持PK定量分析的LBA方法中關(guān)鍵參數(shù)的若干方法以及每種方法的優(yōu)缺點(diǎn)。


1.導(dǎo)論

LBA定量分析方法,是通過比較已知藥物濃度的校準(zhǔn)品與其未知濃度的生物樣本的免疫反應(yīng)活性(immunoreactivity)來測(cè)定生物樣本中大分子藥物的濃度。對(duì)于一個(gè)性能良好的LBA方法,其校準(zhǔn)曲線(合適的logistic regression擬合結(jié)果)應(yīng)具有平行性,即能夠支持如下假設(shè):作為測(cè)試試劑的抗體其結(jié)合特性足夠相似、可用于測(cè)定稀釋了的樣本中的待測(cè)物的濃度。導(dǎo)致非平行性的兩個(gè)主要因素是:(1)校準(zhǔn)參照(比)物質(zhì)與未知待測(cè)物之間的免疫親和力特征的差異(對(duì)捕獲和檢測(cè)試劑而言);(2)校準(zhǔn)曲線基質(zhì)、質(zhì)量控制樣品(QC)基質(zhì)和研究人群的基質(zhì)之間基質(zhì)效應(yīng)的差異(圖1)。


圖1. 造成非平行性的主要原因。(A)校準(zhǔn)曲線: 由替代參照(比)物在替代基質(zhì)中制備校準(zhǔn)曲線;(B)天然樣本: 存在于完整的、未經(jīng)處理的基質(zhì)中的內(nèi)源性待測(cè)物。

對(duì)于旨在測(cè)定外源性蛋白藥物以支持藥代動(dòng)力學(xué)(PK)研究的LBA方法,參照(比)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)通常能得到詳細(xì)的表征,且具有全面的分析證書(CoA)。用作校準(zhǔn)品的參照(比)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)通常與待測(cè)物相同。外加不同濃度的待測(cè)物制備的質(zhì)量控制樣品則用于評(píng)估準(zhǔn)確度、精密度、選擇性、靈敏度和稀釋線性度,以支持最終的定量分析方法的驗(yàn)證。美國(guó)FDA指南草案、EMA指南和行業(yè)共識(shí)白皮書詳細(xì)描述了進(jìn)行這些實(shí)驗(yàn)的相關(guān)建議。目前,這些建議在用于PK定量分析的LBA方法驗(yàn)證中已得到廣泛地運(yùn)用。


對(duì)于測(cè)定內(nèi)源性蛋白質(zhì),如生物標(biāo)志物(biomarker)和“游離”/“總”藥物靶標(biāo)的LBA方法的開發(fā)和認(rèn)證,相關(guān)策略將不同于PK定量分析方法。這是因?yàn)橥ǔ2淮嬖诩兓说?、完全表征的?nèi)源性參照(比)物,且不含待測(cè)物的空白基質(zhì)可能也不存在,故需要一種相對(duì)定量的方法。用于內(nèi)源性待測(cè)物如生物標(biāo)志物的LBA方法的平行性將在后續(xù)文章中作專門討論,敬請(qǐng)關(guān)注。


總而言之,平行性研究是通過評(píng)估稀釋對(duì)生物基質(zhì)中待測(cè)物定量分析的影響,來表述一個(gè)分析方法相對(duì)準(zhǔn)確性(relative accuracy)的一項(xiàng)關(guān)鍵指標(biāo)??梢栽u(píng)估的相關(guān)分析方法的基本特征包括選擇性、基質(zhì)效應(yīng)、所需最低稀釋倍數(shù)(minimum required dilution, MRD)、健康和患病人群中內(nèi)源性待測(cè)物的濃度和LLOQ。


在過去的十多年中,科學(xué)文獻(xiàn)中就平行性實(shí)驗(yàn)操作和適用標(biāo)準(zhǔn)發(fā)表了許多討論結(jié)果。2003年,DeSilva等人建議使用由幾個(gè)Cmax樣本(已測(cè)樣本再分析樣本)制成的混合樣本,以支持PK方法的研究中驗(yàn)證。2011EMA指南建議使用高濃度研究樣本(Cmax研究樣本)稀釋到至少三個(gè)濃度來評(píng)估PK方法的平行性,還建議計(jì)算稀釋樣本之間的精密度以評(píng)估平行性。由于使用了真實(shí)樣本進(jìn)行平行性研究,即研究樣本中的待測(cè)物已經(jīng)處于生物基質(zhì)中,而不是外加待測(cè)物到空白生物基質(zhì)而生成研究樣本。


因此,在某種意義上用于PK定量分析的和用于生物標(biāo)志物的LBA方法在平行性研究中處于相似地位。所以,雖然本文預(yù)期只討論用于PK定量分析的LBA方法的平行性,但下面的討論往往也提到或比較二者。


本文將探討并比較相關(guān)評(píng)估關(guān)鍵參數(shù)的方法,包括平行性實(shí)驗(yàn)和其它傳統(tǒng)的方法,討論如何使用平行性數(shù)據(jù)來指導(dǎo)分析方法的開發(fā)以及每種策略的優(yōu)缺點(diǎn)。


2.平行性和基質(zhì)效應(yīng)

LBA定量測(cè)定存在于生物基質(zhì)中的待測(cè)物,無(wú)需事先萃取。在理想情況下,捕獲/檢測(cè)試劑應(yīng)結(jié)合(并且僅結(jié)合)待測(cè)物,保證其不會(huì)與任何其它的蛋白發(fā)生交叉反應(yīng)。不幸的是,情況往往并非如此。在現(xiàn)實(shí)世界中,生物基質(zhì)中的內(nèi)源性蛋白經(jīng)常阻斷試劑與待測(cè)物的結(jié)合。內(nèi)源基質(zhì)干擾物可以特異性地或非特異性地結(jié)合捕獲/檢測(cè)試劑或待測(cè)物,使得測(cè)試信號(hào)增加或減少。


最常見的非特異性干擾是由于溶血(hemolysis)、脂肪血癥(lipemia)、抗凝劑(anticoagulant)或其他小分子有機(jī)或無(wú)機(jī)物質(zhì)的相互作用造成的。對(duì)PK定量方法的特異性干擾可能來自蛋白藥物的降解產(chǎn)物、內(nèi)源蛋白的類似物、異質(zhì)性抗體(heterophilic antibody)、人抗動(dòng)物抗體、風(fēng)濕因子、可溶性配體、抗藥物抗體、高劑量鉤效應(yīng)(high-dose hook effect)等。對(duì)于潛在的干擾物通常沒有表征良好的參照(比)物可用,而且通常不知道干擾物的性質(zhì),因而無(wú)法直接測(cè)試所有潛在干擾物。


傳統(tǒng)上,會(huì)在方法開發(fā)階段通過外加待測(cè)物/回收率實(shí)驗(yàn)來評(píng)估基質(zhì)效應(yīng)。如果制備標(biāo)準(zhǔn)曲線的基質(zhì)與樣本基質(zhì)相同(例如與大多數(shù)PK定量方法一致),則二者的基質(zhì)效應(yīng)通常相似。優(yōu)化基質(zhì)的選擇更多是為了提高靈敏度(sensitivity),而不是提高準(zhǔn)確度(absolute accuracy)。對(duì)于大多數(shù)需要替代基質(zhì)的測(cè)定內(nèi)源性待測(cè)物的LBA方法,需要使用替代基質(zhì)所制備的標(biāo)準(zhǔn)曲線,計(jì)算overspiked matrix control samples中待測(cè)物的濃度,以評(píng)估絕對(duì)準(zhǔn)確度。但是,當(dāng)天然的空白基質(zhì)不可及時(shí),則需特別謹(jǐn)慎。由于天然基質(zhì)中的內(nèi)源性待測(cè)物的濃度是使用替代基質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)曲線所測(cè)定的,因此無(wú)法保證此類測(cè)定結(jié)果的絕對(duì)準(zhǔn)確度,這是由于潛在的基質(zhì)效應(yīng)差異和潛在的檢測(cè)方法靈敏度的限制。


平行性實(shí)驗(yàn)有助于理解該分析方法的相對(duì)準(zhǔn)確性(relative accuracy)。這是通過繪制測(cè)試信號(hào)與稀釋倍數(shù)或濃度的關(guān)系圖,以評(píng)估相對(duì)精度,從而評(píng)估該方法的基質(zhì)效應(yīng)。處理原始數(shù)據(jù)有幾種不同的方法。這些方法將在"平行性、稀釋線性和選擇性"的章節(jié)中討論。每個(gè)樣本的最終曲線應(yīng)該反映了測(cè)試試劑對(duì)待測(cè)物和基質(zhì)干擾物的綜合親和力(combined binding affinity)。因此,平行性的缺失可能是基質(zhì)干擾存在的標(biāo)志。


此外,通過仔細(xì)研究平行性數(shù)據(jù)的細(xì)節(jié)和趨勢(shì),方法開發(fā)人員可以發(fā)現(xiàn)干擾類型的相關(guān)線索,隨后縮小可能引起基質(zhì)效應(yīng)的物質(zhì)范圍。例如,如果可以通過增加稀釋倍數(shù)來緩解非平行性,則可能發(fā)生了非特異性結(jié)合,可以增加該方法的MRD或優(yōu)化樣品稀釋劑(例如添加阻滯劑、洗滌劑、鹽等)來消除干擾。相反,如果不能稀釋掉基質(zhì)效應(yīng),則有可能是特異性的干擾。抑制或增強(qiáng)結(jié)合反應(yīng)(binding reaction)可以進(jìn)一步指示可能引起干擾的結(jié)合位點(diǎn)??梢蕴剿髯R(shí)別不同表位的新的關(guān)鍵試劑,增加樣本預(yù)處理步驟(例如,堿性處理、酸處理或萃?。?,或添加強(qiáng)力洗滌劑(strong detergent),以消除此類干擾。


3.平行性&選擇性

選擇性是分析方法的一種能力,即在樣本中存在其他成分情況下,定量地測(cè)定待測(cè)物的能力。設(shè)計(jì)良好的LBA應(yīng)該能夠準(zhǔn)確地測(cè)定大多數(shù)受試者樣本中的待測(cè)物,而不會(huì)受到獨(dú)特的個(gè)體基質(zhì)的干擾。根據(jù)FDA指南草案、EMA指南和白皮書,應(yīng)該外加相當(dāng)于LLOQ或附近濃度的待測(cè)物到至少10個(gè)批次的人體個(gè)體基質(zhì)(動(dòng)物6個(gè))中,用以評(píng)估選擇性。目前,此方法適用于PK樣本分析方法的監(jiān)管驗(yàn)證。


在理想情況下,應(yīng)該使用正常和/或患病的單個(gè)人源樣本進(jìn)行平行性實(shí)驗(yàn)。其中從可靠的來源(例如從醫(yī)院獲得的樣本)獲得的并帶有完整的患者醫(yī)療記錄和完整的樣品儲(chǔ)存記錄的新鮮樣本應(yīng)當(dāng)?shù)玫絻?yōu)先考慮,或者也可以使用從商業(yè)來源購(gòu)買的樣本,但是應(yīng)考慮到所購(gòu)基質(zhì)的穩(wěn)定性和可靠性。


通常,稀釋樣本的回計(jì)算濃度可用于評(píng)估定量分析方法的平行性。Stevenson和Purushothama進(jìn)一步建議,分析人員可繪制稀釋后調(diào)整的濃度(dilution-adjusted concentration)與多個(gè)個(gè)人樣本稀釋的示意圖,這可以幫助設(shè)定方法的MRD并評(píng)估方法的選擇性。


MRD設(shè)置應(yīng)當(dāng)使得大多數(shù)樣品在分析方法的定量范圍內(nèi),并且保證MRD以外的多次稀釋仍然能得到準(zhǔn)確的結(jié)果。歐洲生物分析論壇專題小組總結(jié)了處理并行數(shù)據(jù)的替代方法。這些方法包括繪制log[微孔內(nèi)測(cè)定濃度]與稀釋倍數(shù)的關(guān)系圖、稀釋后調(diào)整的濃度與稀釋倍數(shù)的關(guān)系圖、稀釋調(diào)整的相對(duì)誤差(dilution-adjusted relative error)與稀釋倍數(shù)的關(guān)系圖以及l(fā)og[微孔內(nèi)濃度]與log[1/稀釋倍數(shù)] 的關(guān)系圖。這些基于回算濃度的方法允許方法開發(fā)人員根據(jù)預(yù)先設(shè)定的接受標(biāo)準(zhǔn)來評(píng)估該方法的平行性。


對(duì)相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行恰當(dāng)?shù)亟忉寯?shù)據(jù)有助于獲取有利信息。例如平行性缺失可以從兩個(gè)方面來解釋:(1)樣本之間缺乏平行性代表基質(zhì)效應(yīng)和試劑的選擇性(選擇性)問題;(2)校準(zhǔn)品和樣本之間缺乏平行性,即如果所有樣本彼此平行但不平行于校準(zhǔn)曲線,則代表基質(zhì)效應(yīng),或參照(比)物的特異性(specificity)問題,或兩者情況都有。參照(比)物的特異性(specificity)問題則說明參照(比)物的質(zhì)量(quality)存在問題。


圖2顯示了根據(jù)Stevenson和Purushothama的建議,對(duì)可溶性BCMA(sBCMA)方法案例研究數(shù)據(jù)的處理。在本案例研究中,連續(xù)稀釋10個(gè)正常人類血清樣本,使用1%牛血清白蛋白(BSA)磷酸緩沖鹽水(PBS)緩沖液,或1%BSA PBS加0.50%(v/v)Triton X-100緩沖液。校準(zhǔn)曲線分別在1%BSA PBS緩沖液以及1%BSA PBS加0.50%(v/v)Triton X-100緩沖液中制備。然后繪制稀釋后調(diào)整的濃度與[1/稀釋倍數(shù)]的關(guān)系圖,以評(píng)估方法的平行性。


圖2.使用“稀釋后調(diào)整的濃度‘dilution-adjusted concentration’”方法,可溶性BCMA ELISA方法測(cè)定的10個(gè)正常人血清樣本的平行性評(píng)價(jià)。(A)樣品1-5(男),使用1%BSA PBS緩沖液稀釋;(B)樣品6-10(女),使用1%BSA PBS緩沖液; (C)樣品1-5(男),使用1%BSA PBS+0.50%(v/v)Triton X-100緩沖液稀釋;(D)樣品6-10(女),使用1%BSA PBS+0.50%(v/v)Triton X-100緩沖液稀釋。BSA:牛血清白蛋白;PBS:磷酸鹽緩沖生理鹽水。



這些數(shù)據(jù)表明,使用1% BSA PBS緩沖液作為替代基質(zhì)時(shí),大多數(shù)受試者的樣本沒有達(dá)到平行性(圖2A-B)。然而,使用1% BSA PBS加0.50%(v/v)Triton X-100緩沖液在1:27或更大稀釋倍數(shù)時(shí),則顯示了平行性(圖2C-D)。


當(dāng)校準(zhǔn)曲線不存在或與樣品不平行時(shí),完整和稀釋后樣本的回算濃度要么不存在,要么不準(zhǔn)確。所以,使用依賴于回算濃度以評(píng)估樣本之間平行性的方法可能會(huì)得出有誤導(dǎo)性的結(jié)論,建議直接從分析儀器獲取原始測(cè)試信號(hào)以評(píng)估樣本的平行性。


對(duì)于LBA定量方法,測(cè)試信號(hào)與濃度/稀釋倍數(shù)之間的相關(guān)性通常不是線性的。因此,線性關(guān)系圖不能準(zhǔn)確反映樣本之間的平行性。建議使用加權(quán)或無(wú)加權(quán)的4或5參數(shù)logistic回歸(4PL或5PL)模型,以實(shí)現(xiàn)最小方差的最佳曲線擬合。從圖中直接可以看到每個(gè)樣本稀釋曲線的平行關(guān)系,并可以評(píng)價(jià)樣本之間的平行性。一個(gè)局限是不清楚如何為"原始測(cè)試信號(hào)"方法設(shè)置固定的接受標(biāo)準(zhǔn)。每個(gè)樣本的"B"參數(shù)("B"表示4PL和5PL的希爾曲線斜率)可用于評(píng)估方法平行性。也可以進(jìn)一步評(píng)估并應(yīng)用更多的統(tǒng)計(jì)方法,以便更好地解釋數(shù)據(jù)。


圖3演示了如何使用“原始測(cè)試信號(hào)”進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,本圖使用了同一個(gè)sBCMA案例研究中的數(shù)據(jù),繪制了10個(gè)樣本的光密度與[1/稀釋倍數(shù)]的關(guān)系圖。校準(zhǔn)曲線的回歸模型是4PL,由測(cè)試儀器軟件SoftMax? Pro完成回歸分析。實(shí)驗(yàn)使用1% BSA PBS緩沖液作為替代基質(zhì)(圖3A-B)時(shí),這10個(gè)樣本的B參數(shù)的范圍是從0.33到1.11不等,而使用1%BSA PBS加上0.50%(v/v)Triton X-100 緩沖液(圖3C-D)作為替代基質(zhì)時(shí),B參數(shù)的范圍為1.25到1.46。這些數(shù)據(jù)表明,在樣本稀釋劑(sample diluent)中加入0.50%(v/v)Triton X-100,減輕了樣本的基質(zhì)效應(yīng)并改善了方法的平行性。


圖 3. 可溶性B細(xì)胞成熟抗原ELISA測(cè)定方法的平行性評(píng)估。基于10個(gè)正常人血清樣本,并使用"原始信號(hào)"方法和4PL回歸模型進(jìn)行曲線擬合。(A)樣品1-5(男),使用1% BSA PBS緩沖液稀釋;(B)樣品6-10(女),使用1% BSA PBS緩沖液;(C)樣品1-5(男),使用 1%BSA PBS+0.50%(v/v)Triton X-100緩沖液稀釋;(D)樣品6-10(女),使用1%BSA PBS+0.50%(v/v)Triton X-100緩沖液稀釋。BSA:牛血清白蛋白;PBS:磷酸鹽緩沖生理鹽水。


"原始信號(hào)"方法的進(jìn)一步應(yīng)用是可以很輕松地優(yōu)化緩沖液,而不需要在每個(gè)不同的緩沖液中制備一條校準(zhǔn)曲線。圖4演示了使用"原始測(cè)試信號(hào)"方法為替代基質(zhì)的優(yōu)化,進(jìn)而處理數(shù)據(jù)。使用1%BSA PBS緩沖液連續(xù)稀釋3個(gè)正常人血清樣本,稀釋劑中不含Triton X-100,然后分別加入0.25、0.50和1.00%(v/v)的Triton X-100。所有稀釋的樣品都在同一微孔板上分析,無(wú)需添加校準(zhǔn)曲線。再利用光學(xué)密度與[1/dilution]曲線關(guān)系圖評(píng)價(jià)該方法的平行性。數(shù)據(jù)表明,添加了Triton X-100的3組樣本其平行性都得到了提高。最終,1%BSA PBS加上0.50%(v/v)Triton X-100緩沖液被選為替代基質(zhì),以更好地評(píng)估方法的穩(wěn)健性。


圖 4. 使用"原始信號(hào)"方法優(yōu)化替代基質(zhì)。采用4PL模型進(jìn)行曲線回歸擬合。(A)使用 1%BSA PBS緩沖液稀釋的樣品(優(yōu)化之前);(B)使用1% BSA PBS+0.25%(v/v)Triton X-100稀釋的樣本;(C)使用1% BSA PBS+0.50%(v/v)Triton X-100稀釋的樣本;(D)使用1% BSA PBS+1.0%(v/v)Triton X-100稀釋的樣本。BSA:牛血清白蛋白;PBS:磷酸鹽緩沖生理鹽水。


由于為"原始信號(hào)"設(shè)置固定的接受標(biāo)準(zhǔn)的方法尚不確定,因此在解決非平行性問題后,應(yīng)使用"稀釋調(diào)整濃度dilution-adjusted concentration’approach "方法來確認(rèn)該方法的平行性:即使用與樣本稀釋緩沖液相同的緩沖液來制備校準(zhǔn)曲線。


盡管其優(yōu)點(diǎn)顯而易見,但使用平行性實(shí)驗(yàn)來評(píng)估方法的選擇性顯然也存在著挑戰(zhàn):并非總能獲得足夠多且含有高濃度內(nèi)源性待測(cè)物的樣本。另一種方法是:對(duì)多個(gè)加入標(biāo)準(zhǔn)待測(cè)物的單個(gè)樣本進(jìn)行稀釋線性度實(shí)驗(yàn),以評(píng)估方法的選擇性。加標(biāo)樣品的正常濃度可設(shè)置為內(nèi)源性水平加上外加待測(cè)物的濃度?;蛘呒訕?biāo)濃度可以直接用作標(biāo)稱濃度,在減去內(nèi)源性濃度(偏置計(jì)算bias calculation)后,可以獲得正確的測(cè)定濃度。這個(gè)概念和數(shù)據(jù)評(píng)估策略應(yīng)該與平行實(shí)驗(yàn)中所使用的策略相同。


其他平行實(shí)驗(yàn)的挑戰(zhàn)可能包括:當(dāng)需要特殊基質(zhì)類型(如腦脊液、組織勻漿)或基質(zhì)物種(如小鼠)時(shí),有限的可用小樣本體積可能不足以允許進(jìn)行多次稀釋后進(jìn)行生物分析。此外,沒有統(tǒng)一的方法為每個(gè)樣本設(shè)置標(biāo)稱濃度,并評(píng)估方法的平行性。標(biāo)稱濃度可以設(shè)置為來自最大稀釋倍數(shù),且其濃度高于LLOQ的MRD樣本,或者是顯示出平行性的所有稀釋后濃度的平均值。也可以通過計(jì)算每個(gè)稀釋后濃度與標(biāo)稱濃度的百分比偏差,或者所有稀釋后濃度的百分比CV(%CV)評(píng)估平行性。


4.平行性&特異性

特異性是測(cè)試用關(guān)鍵試劑(例如抗體)區(qū)分待測(cè)物和其他成分的能力。LBA測(cè)量的是結(jié)合性反應(yīng)活性,而不是直接測(cè)定質(zhì)量。任何能夠與關(guān)鍵試劑結(jié)合的物質(zhì)都可以生成測(cè)試信號(hào),不論其特異性和親和力如何。這是所有LBA都會(huì)存在的特異性的固有問題。大多數(shù)LBA方法特異性測(cè)試的目標(biāo)并非為了檢測(cè)絕對(duì)的特異性,而是為達(dá)到預(yù)期的應(yīng)用目的,提供有關(guān)被測(cè)物的信息。


LBA方法的特異性取決于關(guān)鍵試劑的特異性。特異性試劑需要在其他技術(shù)(如western blot、surface plasmon resonance、HPLC、LC-MS/MS等)的協(xié)助下,進(jìn)行設(shè)計(jì)、確認(rèn)和選擇。當(dāng)前的特異性測(cè)試方案,采用了學(xué)習(xí)-確認(rèn)的方法。分析方法的特異性是通過計(jì)算使用外加了各種形式的潛在交叉反應(yīng)物的樣本的準(zhǔn)確性來評(píng)估的。但是這是假設(shè)在干擾物質(zhì)是已知的前提下,以基質(zhì)或純化物的形式而提供的。


平行性實(shí)驗(yàn)可以間接地評(píng)估分析方法的特異性。在方法優(yōu)化后,如果在樣本內(nèi)以及樣本和校準(zhǔn)品曲線之間不能取得平行性,則關(guān)鍵試劑的特異性應(yīng)視為可疑。換句話說,在排除了非特異性相關(guān)的基質(zhì)效應(yīng)和參照(比)物的特異性問題之后,關(guān)鍵試劑的特異性可能是導(dǎo)致非平行性的主要原因。但是,與校準(zhǔn)品曲線平行的樣本稀釋也并不能保證分析方法的特異性。有這樣一個(gè)例子,在一個(gè)方法比較實(shí)驗(yàn)中,使用LC-MS/MS方法(靈敏度約為20 pg/ml)來測(cè)試所有樣品中的一個(gè)相關(guān)小分子生物標(biāo)志物,檢測(cè)結(jié)果是在所有樣本均未檢測(cè)到。但是,當(dāng)使用商業(yè)ELISA試劑盒檢測(cè)時(shí),所有樣本卻均顯示出可測(cè)量到的濃度,并且9個(gè)樣本中有6個(gè)樣本取得了平行性(表1)。


表1. 一個(gè)小分子生物標(biāo)志物L(fēng)BA方法的平行數(shù)據(jù)



5.平行性&靈敏度

有兩個(gè)與靈敏度相關(guān)的術(shù)語(yǔ):LOD(limit of detection)和 LLOQ(lower limit of quantitation)。LOD是指產(chǎn)生與背景明顯不同信號(hào)的濃度(例如背景平均值±2或3標(biāo)準(zhǔn)方差),它通常作為靈敏度指標(biāo),供生物標(biāo)志物研究使用 (research use only,RUO)或供診斷試劑盒使用。LLOQ是指已被證明具有可以接受的準(zhǔn)確度、精密度和總誤差水平的待測(cè)物的最小濃度。LLOQ通常大于LOD。


傳統(tǒng)上,生物分析LBA方法的靈敏度(LLOQ)是在執(zhí)行準(zhǔn)確度和精密度運(yùn)行時(shí)中確定的,樣本是將參照(比)標(biāo)準(zhǔn)物加入到空白基質(zhì)而制備的。Stevenson and和Purushothama建議分析來自同一平行性實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù),但使用校準(zhǔn)曲線上的濃度(即稀釋后,調(diào)整濃度之前)來確定檢測(cè)內(nèi)源性待測(cè)物的靈敏度。他們提出了兩種不同的方法來確定LLOQ。


常用稀釋方法(common dilution method)是將在最大稀釋倍數(shù)時(shí)給出平行響應(yīng)的所有單個(gè)樣本中觀察到的最高濃度定為L(zhǎng)LOQ。但使用該種辦法時(shí)存在一個(gè)不足,就是當(dāng)至少一個(gè)樣本的內(nèi)源性濃度明顯高于其他樣品時(shí),確定的LLOQ將高于真正的LLOQ。而另一種方法,共同濃度方法(common concentration method)是將所有樣品都表現(xiàn)出平行性的最高濃度確定為L(zhǎng)LOQ。換言之,任何高于確定LLOQ濃度的樣本,都通過平行實(shí)驗(yàn)表現(xiàn)出相對(duì)的準(zhǔn)確度。對(duì)sBCMA案例研究的數(shù)據(jù),使用了"共同濃度方法"(表2)。


表2. 使用"共同濃度方法"確定可溶性BCMA分析方法的LLOQ

總之,平行實(shí)驗(yàn)是指導(dǎo)早期方法開發(fā)和優(yōu)化的有力工具。它直接評(píng)估待測(cè)物的內(nèi)源性濃度、測(cè)定基質(zhì)效應(yīng)、選擇性和靈敏度,它也是方法特異性的一個(gè)間接指標(biāo)。圖5顯示了一個(gè)使用平行數(shù)據(jù)進(jìn)行系統(tǒng)性方法開發(fā)和優(yōu)化的策略決策樹。

圖5.使用平行性/稀釋線性度實(shí)驗(yàn),以指導(dǎo)方法開發(fā)的決策樹



6.平行性與商用試劑盒的采用

可按質(zhì)量級(jí)別(quality level)或預(yù)期用途對(duì)商用試劑盒進(jìn)行分類。無(wú)論是用于化驗(yàn)室測(cè)試的商業(yè)試劑盒(以支持臨床診斷或預(yù)后),還是用于支持藥物開發(fā)的生物分析測(cè)試,方法開發(fā)的目標(biāo)都是一樣的,即建立一個(gè)有足夠準(zhǔn)確度和靈敏度的、符合預(yù)期用途的、可靠的定量分析方法。


生物分析業(yè)界討論了使用商業(yè)試劑盒開發(fā)和驗(yàn)證定量分析方法的策略,F(xiàn)DA指南草案和EMA指南指出:需要重新驗(yàn)證用于藥物開發(fā)目的的商業(yè)試劑盒,以確保其可靠性。業(yè)界中不同的組織在相關(guān)綜述或研究論文中總結(jié)了當(dāng)前商業(yè)試劑盒所面臨的挑戰(zhàn)以及關(guān)于如何采納和調(diào)整商業(yè)試劑盒的建議。也有相關(guān)白皮書討論了使用singleplex and multiplex試劑盒的方法的驗(yàn)證建議。試劑盒的最終用戶還發(fā)表了一些案例研究,展示了他們采用和認(rèn)證研究級(jí)別試劑盒的策略,這些試劑盒來自不同的供應(yīng)商,并且用于不同的目的。詳見文末的參考文獻(xiàn)。


簡(jiǎn)而言之,需要確認(rèn)參考照(比)物料和關(guān)鍵試劑的質(zhì)量和批次間的變異性,也需要確認(rèn)或重新建立測(cè)試方法的LLOQ和MRD,也可能需要優(yōu)化緩沖液和稀釋劑,并且在有必要時(shí)優(yōu)化檢測(cè)步驟。而評(píng)估上述所有內(nèi)容最有效的方法則是通過平行性實(shí)驗(yàn)。因此,強(qiáng)烈建議在方法開發(fā)的早期階段進(jìn)行平行性實(shí)驗(yàn)。如果在研究期間觀察到非平行性,則建議使用相同的故障排除路線(見圖5)。


圖5.使用平行性/稀釋線性度實(shí)驗(yàn),以指導(dǎo)方法開發(fā)的決策樹。



7.平行性與多通路復(fù)用的(multiplex)LBAs

與單通路LBAs相比,且考慮到節(jié)省樣本體積和分析時(shí)間,多通路復(fù)用的LBAs似乎更具吸引力。但是,由于檢測(cè)環(huán)境極其復(fù)雜,大多數(shù)多通路復(fù)用測(cè)試方法暫無(wú)法達(dá)到與單通路測(cè)試方法相同的質(zhì)量水平。


關(guān)于符合其用途(fit-for-purpose)的多通路復(fù)用LBA方法的驗(yàn)證,Jani等人指出,除了面臨與單通路LBA方法相同的挑戰(zhàn)外,對(duì)于多通路復(fù)用LBA方法的開發(fā)還需要考慮其它獨(dú)特的挑戰(zhàn): 包括所有待測(cè)物的定量范圍和MRD的設(shè)置,不同試劑抗體對(duì)和待測(cè)物之間的交叉反應(yīng)(cross-reactivity)以及串?dāng)_(crosstalk),由于well-to-well or spot-to-spot physical‘carryover殘留’所造成的串?dāng)_。


平行性研究(parallelism)或外加待測(cè)物的稀釋線性度(spiked dilutional linearity)實(shí)驗(yàn)可以應(yīng)對(duì)上面所列舉的挑戰(zhàn): (1)靈敏度和MRD:可以使用與單通路LBA相同的方法,對(duì)每個(gè)待測(cè)物設(shè)置靈敏度要求,應(yīng)當(dāng)選擇對(duì)所有待測(cè)物實(shí)現(xiàn)平行性的最大稀釋度作為方法的MRD;(2)交叉反應(yīng):可以通過將不同濃度的捕獲或檢測(cè)抗體分別加入到不同的樣本中,然后進(jìn)行平行性實(shí)驗(yàn)來評(píng)估;(3)串?dāng)_(Crosstalk):可以通過將每個(gè)高濃度待測(cè)物分別外加到不同的樣本中,然后進(jìn)行稀釋線性度(spiked dilutional linearity/spiked parallelism)實(shí)驗(yàn)來評(píng)估,或者可以選擇一個(gè)樣本,其某個(gè)待測(cè)物的內(nèi)源性濃度顯著地高于其他待測(cè)物(如果有的話),然后進(jìn)行平行性實(shí)驗(yàn)。


當(dāng)然還有其他辦法可以解決交叉反應(yīng)和串?dāng)_的問題。如“失蹤的人(Missing man)技術(shù)”,即除一種試劑外,每次將所有關(guān)鍵試劑均添加到測(cè)試中,可用于評(píng)估試劑的交叉反應(yīng)。此外,改變一個(gè)待測(cè)物的濃度,同時(shí)保持其它待測(cè)物處于低濃度范圍,是解決串?dāng)_問題的另一個(gè)方法。如果使用商業(yè)試劑盒,會(huì)由于重復(fù)這些實(shí)驗(yàn)而造成較高的復(fù)雜性和成本,如果有可能的話建議始終從試劑盒生產(chǎn)商處獲取相關(guān)原始數(shù)據(jù)的副本。


8.未來展望

平行性實(shí)驗(yàn)可用于研究LBA分析方法的基質(zhì)效應(yīng)、選擇性和靈敏度等問題。然而,作為所有LBA方法都存在的問題,并不能直接通過平行性實(shí)驗(yàn)來研究方法的特異性(specificity)。但在方法優(yōu)化之后,若樣本分析中出現(xiàn)了平行性的缺失,則很可能是由于其特異性不佳。


LBA方法的特異性(specificity)取決于關(guān)鍵的測(cè)試試劑(例如,抗體對(duì))。關(guān)鍵試劑的特異性必須由供應(yīng)商或最終用戶進(jìn)行評(píng)估,以確保方法的效能。平行性數(shù)據(jù)的數(shù)學(xué)解釋為表征LBA方法的特異性提供了一些線索。此外,還可以評(píng)估和使用更多的數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)工具,以便從平行性數(shù)據(jù)中找出更多細(xì)節(jié)(關(guān)于試劑結(jié)合待測(cè)物、干擾物的活性)。其他技術(shù)如western blot,surface plasmon resonance,HPLC和LC-MS/MS,也可助于確定非平行性的根本原因,分析人員應(yīng)根據(jù)需要適當(dāng)使用這些技術(shù)。


然而,對(duì)用于內(nèi)源性待測(cè)物的LBA方法,尚不清楚特異性表征到什么程度才是足夠的。且如果要確定絕對(duì)的特異性(事實(shí)上并不總是需要),就需要投入大量的資源,而這些資源本可以在其它地方使用,因?yàn)?/span>開發(fā)具有良好特征的內(nèi)源性LBA的最終目標(biāo)是確保它們具有足夠的靈敏度和準(zhǔn)確度,以定量分析想要測(cè)量的變化和物質(zhì)。


9.結(jié)論

平行性研究是通過評(píng)估稀釋對(duì)生物基質(zhì)中待測(cè)物定量分析的影響,來表述相對(duì)準(zhǔn)確性的一項(xiàng)關(guān)鍵指標(biāo)。可以評(píng)估的相關(guān)分析方法的基本特征包括選擇性、基質(zhì)效應(yīng)、所需最低稀釋倍數(shù)、健康和患病人群中內(nèi)源性待測(cè)物的濃度和LLOQ。


下面將簡(jiǎn)單介紹對(duì)于這類LBA方法應(yīng)如何進(jìn)行類似的評(píng)估。


表3顯示了使用平行性、稀釋線性度(加標(biāo)平行性)和加標(biāo)/回收方法來評(píng)估內(nèi)源性LBA方法關(guān)鍵參數(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)。與大多數(shù)外源性藥物的定量方法不同,內(nèi)源性(例如,生物標(biāo)志物)LBA方法通常需要替代參照(比)標(biāo)準(zhǔn)物和不含有待測(cè)物的替代基質(zhì)。用于內(nèi)源性LBA的照(比)標(biāo)準(zhǔn)物,通常既非高度純化,也非表征良好,且很可能不能完全代表待測(cè)的內(nèi)源性蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)通常是異質(zhì)性(heterogeneous)的,在其天然基質(zhì)中存在著多個(gè)異構(gòu)體(isoforms)。


表3.平行性、稀釋線性度和加標(biāo)/回收方法(spike/recovery)的優(yōu)缺點(diǎn)以及相關(guān)評(píng)估參數(shù)


替代基質(zhì)的基質(zhì)效應(yīng)由于基質(zhì)生物學(xué)的不同,通常會(huì)不同于正常人或目標(biāo)疾病人群的基質(zhì)。用于內(nèi)源性待測(cè)物的LBA方法的所有獨(dú)特特性使得這樣的分析方法往往難于使用與傳統(tǒng)的完全定量的PK方法相同的方式去進(jìn)行開發(fā)和評(píng)估。開發(fā)具有良好特征的、相對(duì)定量的LBA方法的首要目標(biāo)是區(qū)分疾病和正常人群(即以診斷/預(yù)后為目的),或區(qū)分來自經(jīng)藥物治療/未經(jīng)治療的個(gè)別樣本(即以藥物開發(fā)為目的),而不是測(cè)定每個(gè)樣本的實(shí)際真實(shí)濃度。

加標(biāo)/回收實(shí)驗(yàn)被證明是用于完全定量PK的LBA方法的開發(fā)和驗(yàn)證最有效的和應(yīng)用廣泛的方法,但相對(duì)精度的測(cè)試方法并不總是需要做這些實(shí)驗(yàn)。當(dāng)樣本沒有足夠高的內(nèi)源性待測(cè)物濃度以支持平行性實(shí)驗(yàn)時(shí),加標(biāo)稀釋線性度的實(shí)驗(yàn)可用于證明分析方法的相對(duì)準(zhǔn)確度。需要仔細(xì)測(cè)試外加的參照(比)標(biāo)準(zhǔn)物和內(nèi)源性天然蛋白之間的差別。


盡管生物分析業(yè)界就如何進(jìn)行平行性實(shí)驗(yàn)以及如何評(píng)估平行性數(shù)據(jù)尚未達(dá)成完全的共識(shí),但這不影響將平行性數(shù)據(jù)用于方法開發(fā)和優(yōu)化。平行性實(shí)驗(yàn)是一個(gè)強(qiáng)大的工具,可以解決用于內(nèi)源性待測(cè)物定量的LBA方法的基本問題(方法的特異性除外)。平行性實(shí)驗(yàn)也提供了對(duì)最接近實(shí)際研究樣本的模仿,并且為相對(duì)定量的和適合其用途(fit-for-purpose)的分析方法的設(shè)計(jì)提供了充分的信息。


10. 特別聲明

本文如有疏漏和誤讀相關(guān)指南、數(shù)據(jù)的地方,請(qǐng)讀者評(píng)論和指正。所有引用的原始信息和資料均來自已經(jīng)發(fā)表學(xué)術(shù)期刊、官方網(wǎng)絡(luò)報(bào)道等公開渠道, 不涉及任何保密信息。參考文獻(xiàn)的選擇考慮到多樣化但也不可能完備。歡迎讀者提供有價(jià)值的文獻(xiàn)及其評(píng)估。


11. 擴(kuò)展閱讀






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